保护柱是液相色谱分析中重要的色谱耗材，使用保护柱可大大降低分析柱受污染的程度，延长分析柱使用寿命。

保护柱从材质上分：不锈钢材质和PEEK（聚醚醚酮）材质

PEEK 材质
样品对金属离子比较敏感时，选择PEEK材质比较合适，比如某些蛋白分析会用到PEEK材质的分析柱，主要就是考虑到这方面的因素；

不锈钢材质
大部分小分子化合物的分析，选择不锈钢材质保护柱居多，特别是当流动相体系使用到四氢呋喃（THF）或DMSO等一些溶解性较强的溶剂时，必须选择不锈钢材质，甚至对于HPLC系统的管路也需要替换成不锈钢材质，因THF对于PEEK管路有相当强的腐蚀作用。

从结构上分：卡套式（柱芯+柱套）和直接填装短柱

直接填装短柱
这种结构的保护柱实质就是短的色谱柱，一般填装的填料跟分析柱填料*一样。生物样品分析中，用这种类型保护柱居多，除可过滤一些不溶颗粒外，还可除去一些在分析柱上易吸附的杂质。缺点是，一次性使用，污染严重时，只能报废。

卡套式保护柱
卡套式保护柱的柱套可反复使用，柱芯污染后可替换，厂家会提供配套的保护柱芯，但购买时需要注意，柱芯中有与分析柱匹配的填料，需要确认柱芯中的填料类型再购买。同时，柱芯和柱套需是来源于同一厂家的同一规格，否则，会存在匹配上的差异，导致峰型异常或者漏液。

从连接方式上分：独立式和直连式

独立式保护柱
保护柱和分析柱之间用一段管路连接，不用担心与分析柱在连接上的匹配问题。但使用管路连接时，连接不当容易产生死体积。

直连式保护柱
保护柱接口带螺纹，可直接与分析柱连接，死体积小，UPLC分析时建议选择直连式保护柱；缺点：购买时需保证接口与分析柱匹配。